日前，由華南農(nóng)業(yè)大學亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室牽頭完成的重大研究成果《高雜合度荔枝基因組中兩個不同單倍型表明早晚熟栽培品種各自獨立馴化》一文發(fā)表于《自然—遺傳學》(Nature Genetics)。該研究成果將為未來荔枝功能基因組研究提供重要的參考，對促進荔枝品種改良和產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展具有重要意義。

　　2021年國內(nèi)荔枝生產(chǎn)總產(chǎn)值達140億元以上。廣東是全國荔枝第一大省，面積和產(chǎn)量占全國“半壁江山”。產(chǎn)業(yè)發(fā)展離不開科技支撐?；蚪M是植物性狀形成的“導航圖”，解碼荔枝基因組，不僅能全面提升對荔枝重要經(jīng)濟性狀形成機制的認知，研發(fā)相應的育種和栽培調(diào)控技術(shù)，還能為推動其他無患子科植物如龍眼的相關(guān)研究提供重要參考。

　　在華南農(nóng)業(yè)大學李建國研究員和胡桂兵教授負責的荔枝基因組項目研究中，科學家們利用二代Illunina、三代PacBio、Hi-C和10XGenomics等最新的基因組測序數(shù)據(jù)，通過優(yōu)化基因組組裝策略，完成“妃子笑”荔枝基因組假染色體水平的組裝，組裝完整度BUSCO評估96.2%;同時完成基因組編碼基因的結(jié)構(gòu)注釋，得到31896個結(jié)構(gòu)基因，注釋完整度BUSCO評估94.8%。荔枝基因密碼的破譯將為未來荔枝功能基因組研究提供重要的參考。

　　荔枝鮮果上市主要集中在5至7月，生產(chǎn)中時常出現(xiàn)果品季節(jié)性過剩，嚴重影響了荔枝種植的經(jīng)濟效益。該論文從基因組層面對荔枝開花調(diào)控機制進行了系統(tǒng)性研究，發(fā)現(xiàn)荔枝中一段特定的DNA序列缺失，可能是導致荔枝不同花期形成的重要因素。

　　“這一段DNA序列缺失與荔枝花期早晚關(guān)系緊密。來源于云南的特早熟品種基因組有這個缺失，但來源于海南的晚熟品種中沒有。而‘妃子笑’作為特早熟和晚熟的雜交種，則是‘雜合’的缺失，也就是說‘妃子笑’的兩條同源染色體中一條(來源于特早熟的父本)有這個缺失，而另外一條(來源于晚熟的母本)沒有。這也正好與‘妃子笑’的開花期在特早熟和晚熟之間相對應?！比A南農(nóng)業(yè)大學園藝學院教授夏瑞說。

　　這個DNA序列缺失可以開發(fā)為簡便的分子標記，用于不同開花期荔枝品種的選育。這對荔枝針對花期和成熟期性狀的選育種工作非常有價值，因為荔枝易腐爛、難貯存，選育更多極早或極晚開花的荔枝新品種對延長荔枝上市季節(jié)、減少市場季節(jié)性銷售壓力、提升荔枝種植效益非常重要。(記者吳春燕、雷愛俠)